| モクマオウ目 | モクマオウ科（２） | ||
| クルミ目 | ヤマモモ科（１） | クルミ科（２） | |
| ヤナギ目 | ヤナギ科（１８） | ||
| ブナ目 | カバノキ科（１２） | ブ ナ科（２１） | |
| イラクサ目 | ニ レ科（４） | トチュウ科（１） | ク ワ科（２２） |
| イラクサ科（３６） | |||
| ヤマモガシ目 | ヤマモガシ科（７） | ||
| ビャクダン目 | ビャクダン科（２） | ヤドリギ科（６） | |
| ツチトリモチ目 | ツチトリモチ科（４） | ||
| タデ目 | タ デ科（５９） | ||
| アカザ目 | ヤマゴボウ科（３） | オシロイバナ科（２） | ザクロソウ科（１） |
| ツルナ科（５） | スベリヒユ科（８） | ツルムラサキ科（１） | |
| ナデシコ科（８３） | アカザ科（１６） | ヒ ユ科（１５） | |
| サボテン目 | サボテン科（６１） | ||
| モクレン目 | モクレン科（１０） | バンレイシ科（３） | マツブサ科（２） |
| シキミ科（１） | ロウバイ科（５） | クスノキ科（１８） | |
| カツラ科（１） | ヤマグルマ科（１） | ||
| キンポウゲ目 | キンポウゲ科（１４０） | シラネアオイ科（２） | メ ギ科（１７） |
| アケビ科（４） | ツヅラフジ科（３） | スイレン科（１０） | |
| ハ ス科（１） | マツモ科（１） | ||
| コショウ目 | ドクダミ科（２） | コショウ科（４） | センリョウ科（４） |
| ウマノスズクサ目 | ウマノスズクサ科（４２） | ||
| ヤッコソウ目 | ヤッコソウ科（１） | ||
| オトギリソウ目 | ボタン科（４） | マタタビ科（３） | オクナ科（１） |
| ツバキ科（２３） | オトギリソウ科（２１） | マルクグラビア科（１） | |
| サラセニア目 | サラセニア科（２） | ウツボカズラ科（１） | モウセンゴケ科（８） |
| ケシ目 | ケ シ科（３７） | フウチョウソウ科（１） | アブラナ科（７８） |
| バラ目 | スズカケノキ科（１） | マンサク科（１３） | ベンケイソウ科（４３） |
| ユキノシタ科（１０４） | トベラ科（１） | バ ラ科（１７５） | |
| マ メ科（１４３） | |||
| カワゴケソウ目 | カワゴケソウ科（１） | ||
| フウロソウ目 | カタバミ科（１６） | フウロソウ科（２７） | ノウゼンハレン科（１） |
| ハマビシ科（１） | ア マ科（３） | トウダイグサ科（５４） | |
| ユズリハ科（３） | |||
| ミカン目 | ミカン科（２７） | ニガキ科（１） | センダン科（１） |
| キントラノオ科（４） | ヒメハギ科（６） | ||
| ムクロジ目 | ドクウツギ科（１） | ウルシ科（６） | カエデ科（２０） |
| ムクロジ科（４） | トチノキ科（２） | ツリフネソウ科（９） | |
| アワブキ科（１） | |||
| ニシキギ目 | モチノキ科（１２） | ニシキギ科（１３） | ミツバウツギ科（２） |
| ツ ゲ科（３） | クロタキカズラ科 | ||
| クロウメモドキ目 | クロウメモドキ科（５） | ブドウ科（５） | |
| アオイ目 | ホルトノキ科（２） | シナノキ科（４） | アオイ科（３１） |
| パンヤ科（２） | アオギリ科（４） | ||
| ジンチョウゲ目 | ジンチョウゲ科（１２） | グ ミ科（７） | |
| スミレ目 | イイギリ科（２） | スミレ科（１１６） | キブシ科（４） |
| トケイソウ科（２） | ギョリュウ科（１） | ミゾハコベ科（１） | |
| パパイア科（１） | シュウカイドウ科（７） | ||
| ウリ目 | ウ リ科（１７） | ||
| フトモモ目 | ミソハギ科（１２） | ヒ シ科（３） | フトモモ科（１２） |
| ハマザクロ科 | ザクロ科（１） | サガリバナ科（１） | |
| ノボタン科（７） | ヒルギ科（２） | シクンシ科 | |
| アカバナ科（２７） | アリノトウグサ科（５） | ヤマトグサ科（１） | |
| スギナモ科（１） | |||
| セリ目 | ウリノキ科（２） | ミズキ科（１１） | ウコギ科（１６） |
| セ リ科（６９） | オオギリ科（２） |
| イワウメ目 | イワウメ科（１２） | ||
| ツツジ目 | リョウブ科（１） | イチヤクソウ科（１４） | ツツジ科（８５） |
| エパクリス科（２） | ガンコウラン科（１） | ||
| サクラソウ目 | ヤブコウジ科（９） | サクラソウ科（４６） | |
| イソマツ目 | イソマツ科（６） | ||
| カキノキ目 | アカテツ科（１） | カキノキ科（３） | エゴノキ科（２） |
| ハイノキ科（７） | |||
| モクセイ目 | モクセイ科（２５） | ||
| リンドウ目 | マチン科（５） | リンドウ科（４３） | ミツガシワ科（６） |
| キョウチクトウ科（１４） | ガガイモ科（２６） | アカネ科（６３） | |
| シソ目 | ハナシノブ科（４） | ヒルガオ科（２５） | ハゼリソウ科（１） |
| ムラサキ科（３０） | クマツヅラ科（３８） | アワゴケ科（２） | |
| シ ソ科（１４７） | ナ ス科（４１） | フジウツギ科（５） | |
| ゴマノハグサ科（１２４） | ウルップソウ科（２） | ノウゼンカズラ科（１０） | |
| キツネノマゴ科（４０） | ゴ マ科（２） | イワタバコ科（１７） | |
| ハマウツボ科（５） | タヌキモ科（１０） | ハマジンチョウ科（１） | |
| ハエドクソウ科（１） | |||
| オオバコ目 | オオバコ科（６） | ||
| マツムシソウ目 | スイカズラ科（４６） | レンプクソウ科（１） | オミナエシ科（１０） |
| マツムシソウ科（５） | |||
| キキョウ目 | キキョウ科（３９） | クサトベラ科（１） | キ ク科（４３８） |
| オモダカ目 | オモダカ科（６） | ハナイ科（１） | リムノカリス科（１） |
| トチカガミ目 | トチカガミ科（４） | ||
| イバラモ目 | ホロムイソウ科（１） | シバナ科（１） | イバラモ科 |
| ヒルムシロ科（７） | イトクズモ科 | アマモ科 | |
| ホンゴウソウ目 | ホンゴウソウ科（２） | ||
| ユリ目 | ユ リ科（１９７） | リュウゼツラン科（２０） | アルストロメリア科（１） |
| ビャクブ科（２） | ヒガンバナ科（２８） | キンバイザサ科（２） | |
| タシロイモ科（１） | ヤマノイモ科（６） | ミズアオイ科（６） | |
| ハエモドラル科（１） | アヤメ科（２９） | ヒナノシャクジョウ科（５） | |
| タヌキアヤメ科（１） | |||
| イグサ目 | イグサ科（１３） | ||
| パイナップル目 | パイナップル科（７） | ||
| ツユクサ目 | ツユクサ科（１４） | ホシクサ科（９） | |
| イネ目 | イ ネ科（１５７） | ||
| ヤシ目 | ヤ シ科（１８） | ||
| パナマソウ目 | パナマソウ科（１） | ||
| サトイモ目 | サトイモ科（５０） | ウキクサ科（５） | |
| タコノキ目 | タコノキ科（２） | ミクリ科（４） | ガ マ科（３） |
| カヤツリグサ目 | カヤツリグサ科（１２４） | ||
| ショウガ目 | バショウ科（８） | ショウガ科（１３） | カンナ科（３） |
| クズウコン科（７） | |||
| ラン目 | ラ ン科（４０３） |
| ソテツ目 | ソテツ科（６） | ||
| イチョウ目 | イチョウ科（１） | ||
| マツ目 | マツ科（１７） | スギ科（５） | コウヤマキ科（１） |
| ヒノキ科（１１） | マキ科（１） | イヌガヤ科（１） | |
| イチイ科（２） | ナンヨウスギ科（４） | ||
| グネツム目 | マオウ科（１） |
| マツバラン目 | マツバラン科（１） | ||
| ヒカゲノカズラ目 | ヒカゲノカズラ科（１７） | ||
| イワヒバ目 | イワヒバ科（１１） | ||
| ミズニラ目 | ミズニラ科（１） | ||
| トクサ目 | トクサ科（２） | ||
| ハナヤスリ目 | ハナヤスリ科（８） | ||
| リュウビンタイ目 | リュウビンタイ科（１） | ||
| シダ目 | ゼンマイ科（４） | キジノオシダ科（６） | ウラジロ科（３） |
| フサシダ科（２） | コケシノブ科（８） | ヘゴ科（４） | |
| コバノイシカグマ科（１１） | ホングウシダ科（５） | シノブ科（１） | |
| ツルシダ科（５） | ホウライシダ科（１４） | シシラン科（２） | |
| イノモトソウ科（１５） | チャセンシダ科（２４） | シシガシラ科（１０） | |
| ツルキジノオ科（２） | オシダ科（６６） | ヒメシダ科（１７） | |
| イワデンダ科（３３） | スジヒトツバ科（１） | ヤブレガサウラボシ科 | |
| ウラボシ科（２９） | ヒメウラボシ科（２） | ||
| デンジソウ目 | デンジソウ科（１） | ||
| サンショウモ目 | サンショウモ科（２） | アカウキクサ科（３） |
| ウロコゴケ目 | クサリゴケ科（１） | ||
| ゼニゴケ目 | ゼニゴケ科（１） | ジャゴケ科（１） | ウキゴケ科（１） |
| ミズゴケ目 | ミズゴケ科（２） | ||
| シッポゴケ目 | エビゴケ科（１） | シッポゴケ科（１） | |
| ホンマゴケ目 | ハリガネゴケ科（１） | チョウチンゴケ科（２） | ヒノキゴケ科（１） |
| タマゴケ科（１） | |||
| イヌマゴケ目 | ハイヒモゴケ科（１） | コウヤノマンネングサ科（１） | |
| アブラゴケ目 | クジャクゴケ科（１） | ||
| シトネゴケ目 | ハイゴケ科（１） | イワダレゴケ科（１） | |
| キセルゴケ目 | キセルゴケ科（１） | ||
| スギゴケ目 | スギゴケ科（２） | ||
| ホウオウゴケ目 | ホウオウゴケ科（１） |
| ニクザキン目 | ニクザキン科（１） | ||
| シロキクラゲ目 | シロキクラゲ科（１） | ||
| キクラゲ目 | キクラゲ科（１） | ||
| ビョウタケ目 | テングノメシガイ科（１） | ズキンタケ科（１） | |
| チャワンタケ目 | ノボリリュウタケ科（１） | ピロネマキン科（２） | ベニチャワンタケ科（２） |
| アミガサタケ科（３） | |||
| アカキクラゲ目 | アカキクラゲ科（１） | ||
| ヒダナシタケ目 | フサヒメホウキタケ科（１） | ホウキタケ科（１） | ラッパタケ科（１） |
| シロソウメンタケ科（６） | アンズタケ科（１） | サルノコシカケ科（５） | |
| マンネンタケ科（２） | ニンギョウタケモドキ科（１） | ||
| マツタケ目 | キシメジ科（１１） | ヒラタケ科（１） | イッポンシメジ科（１） |
| テングタケ科（８） | ハラタケ科（４） | ヒトヨタケ科（３） | |
| モエギタケ科（２） | イグチ科（６） | オニイグチ科（１） | |
| ベニタケ科（５） | フウセンタケ科（１） | ||
| ホコリタケ目 | ヒメツチグリ科（３） | ツチグリ科（１） | クチベニタケ科（１） |
| ホコリタケ科（３） | |||
| スッポンタケ目 | スッポンタケ科（３） | ||
| ユーロチウム目 | エダウチホコリタケ科（１） |
ＢＡＮＮＥＲ| 北海道 | 大雪山 | 知床半島 | オホーツク沿岸 | |
| 東北地方 | 早池峰山 | 月山 | 飯豊山 | 福島県会津坂下町 |
| 尾瀬 | ||||
| 関東地方 | 谷川岳 | 鳴神山 | 栃木県みかも山 | 渡良瀬遊水池 |
| 筑波山 | 生瀬富士 | ひたちなか海浜公園 | 秩父地方 | |
| 東京都北区周辺 | 妙義山 | 群馬県多野山地 | 河口湖周辺 | |
| 奥多摩地方 | 富士山 | 横浜市港南区 | 横浜市舞岡自然公園 | |
| 横浜市上郷市民の森 | 大船フラワーセンター | 高尾山周辺 | 山梨県乙女峠 | |
| 箱根湿生花園 | 伊豆半島 | 八丈島 | 八ヶ岳 | |
| 南アルプス・北岳 | 南アルプス・鳳凰三山 | 車山高原 | 木曽駒ヶ岳 | |
| 北アルプス・白馬岳 | 立山黒部ｱﾙﾍﾟﾝﾙｰﾄ | |||
| 北陸地方 | 新潟県内各地 | 佐渡島 | ||
| 東海地方 | 葦毛湿原 | 比丘尼城趾 | 渥美半島 | |
| 近畿地方 | 伊吹山 | |||
| 中国地方 | 岡山県各地 | 山口県秋吉台 | 山口県角島 | |
| 四国地方 | 牧野植物園 | |||
| 九州地方 | 長崎県内各地 | 長崎県立亜熱帯植物園 | 長崎県民の森 | 多良岳 |
| 雲仙岳 | 北九州市平尾台 | 古処山 | 英彦山 | |
| 尾鈴山 | 宮崎市加江田渓谷 | 高隈山 | 薩摩半島 | |
| 阿蘇 | 奄美大島 | |||
| 沖縄地方 | 沖縄本島 |